航班資訊
馬祖-基隆交通船 /新臺馬輪
新臺馬輪除週二航修，每日晚上10點自基隆開航
單日航班：基隆→南竿→東引→基隆(先馬後東)
雙日航班：基隆→東引→南竿→基隆(先東後馬)
基隆→南竿：全票1,050元、半票525元(經濟艙)
南竿→基隆：全票1,000元、半票500元(經濟艙)
全港通航業公司(新臺馬輪)
服務電話：02-2425-6777 (基隆)
服務時間：08:30-12:00、13:00-17:00
全港通航業公司：https://client.matsu.idv.tw/apt/
南竿-東引交通船 /臺馬之星、新臺馬輪
南竿→東引：單日由臺馬之星於上午08:30開航
雙日由新臺馬輪於上午09:30開航
東引→南竿：單日由新臺馬輪於上午07:00開航
雙日由臺馬之星於上午07:30開航
全票400元、半票200元
全港通航業公司(新臺馬輪)
服務電話：02-2425-6777(基隆)、0836-23888 (南竿)、0836-77077(東引)
基隆服務時間：08:30-12:00、13:00-17:00
南竿服務時間：10:00-12:00、13:00-17:00
東引服務時間：10:00-12:00
全港通航業公司：https://client.matsu.idv.tw/apt/
世洋機械科技公司(臺馬之星)
服務電話：02-2436-7812(基隆)、0836-22815(南竿)、0836-76185(東引)
南竿-東引交通船 /東海明珠、南北之星
當新臺臺馬輪或臺馬之星於檢修無法開航時，將由東海明珠或南北之星替代，開航時間請留意臨時航班公告。
全票400元、半票200元
南北海運股份有限公司(東海明珠、南北之星)
服務電話0836-22193
服務時間：08:00-12:00、13:30-17:30
線上訂位服務：馬祖e點通
南北海運公司：https://client.matsu.idv.tw/North-South/
南竿-莒光交通船 /東海明珠、南北之星
每日三班往返：
南竿→莒光：07:00、11:00、14:30
單月：南竿→西莒→東莒→南竿(先西後東)
雙月：南竿→東莒→西莒→南竿(先東後西)
西莒→南竿：
單月：07:50、11:50、15:20
雙月：08:10、12:10、15:40
東莒→南竿：
單月：08:10、12:10、15:40
雙月：07:50、11:50、15:20
全票250元、半票125元。(非設籍)
南北海運股份有限公司(東海明珠、南北之星)
服務電話0836-22193
服務時間：08:00-12:00、13:30-17:30
線上訂位服務：馬祖e點通
南北海運公司：https://client.matsu.idv.tw/North-South/
西莒-東莒交通船 /莒光之星、莒光號
每日四班往返：
西莒→東莒 07:30、10:00、14:30、17:10
東莒→西莒 07:40、10:10、14:40、17:20
航程約10分鐘
現場購票：全票80元、半票40元
莒光航業股份有限公司(莒光之星/莒光號)
服務電話：0836-89121
南、北竿交通船
| 南竿→北竿 開航 | 北竿→南竿 開航 | ||
| 07：00 | 13：00 | 07：30 | 13：30 |
| 08：00 | 14：00 | 08：30 | 14：30 |
| 09：00 | 15：00 | 09：30 | 15：20 |
| 10：00 | 16：00 | 10：30 | 16：30 |
| 11：00 | 17：10 | 11：30 | 17：30 |
| 12：00 | 12：30 | ||
現場購票：全票160元、半票80元(請出示相關證件)、縣民全票110元、團體票150元(20人以上團體)
南北海運股份有限公司
0836-22193(南竿)、0836-55388(北竿)
大和航業股份有限公司
0836-22130 (南竿)、0836-56599(北竿)
長億海運股份有限公司
0836-26169 (南竿)